Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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