Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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