Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms