Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms