Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms