Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms