Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntrobQ8CB62 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntrobQ8CB62 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms