Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4aQ8C9S8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Atg4aQ8C9S8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Atg4aQ8C9S8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Atg4aQ8C9S8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4aQ8C9S8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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