Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms