Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVT6

Pp2d1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pp2d1Q8BVT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms