Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PgghgQ8BP56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PgghgQ8BP56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms