Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3bQ8BHK2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scn3bQ8BHK2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms