Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms