Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms