Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep78Q6IRU7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms