Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt72Q6IME9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms