Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PcolceQ61398 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PcolceQ61398 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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