Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms