Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P4ha2Q60716 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P4ha2Q60716 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms