Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sco1Q5SUC9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms