Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trdv4Q5R1A3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms