Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Carmil2Q3V3V9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms