Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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