Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms