Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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