Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gdf3Q07104 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gdf3Q07104 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gdf3Q07104 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gdf3Q07104 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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