Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top1Q04750 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms