Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms