Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RykQ01887 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RykQ01887 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms