Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1bP97358 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1bP97358 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1bP97358 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1bP97358 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms