Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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