Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cct3P80318 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms