Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms