Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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