Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms