Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms