Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms