Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms