Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms