Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TesP47226 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TesP47226 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TesP47226 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TesP47226 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TesP47226 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms