Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtlP38585 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtlP38585 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TtlP38585 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtlP38585 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TtlP38585 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms