Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HmgclP38060 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms