Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpargP37238 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpargP37238 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpargP37238 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpargP37238 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpargP37238 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpargP37238 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms