Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms