Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms