Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms