Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3aP23116 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms