Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clk1P22518 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clk1P22518 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clk1P22518 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clk1P22518 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms