Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A1P19634 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms