Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18524 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18524 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18524 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms